玩家进入游戏以后最初的设定是一名学生，然后被选中加入 第X小队 ，这是一个使用超能力身经百战的组织，他们要在城市迷宫中对抗各种怪物，而玩家将成为新的主力军。

团结技需要全部小队成员的配合才能发动。团结技分为三种：勇气、魔法和学术。合理选择团结技的施放时机，将效果最大化。

在《作战巴别塔》中特有的新技能，玩家通过佩戴特殊物品来进提升魔法和技能效果。这类技能不受限于角色的血代码，只取决于特定的物品。

和《作战深渊》中一样，玩家经历的战斗越多，地下城迷宫就越危险。起伏系统将让玩家更清楚地了解自己面临的危险和奖励。